Martyre du Ier siècle ap. J.-C., saint Prisca demeure mystérieuse. La tradition l'identifie comme la fille du couple romain Priscille et Aquila, proches de saint Paul, ou même comme la femme d'Aquila. Agée de 13 ans, elle serait morte en martyre sous le règne de l'empereur Claudius pour avoir refusé d'adorer les dieux. Au IIIe siècle, sous le pontificat du pape Eutychien, son corps est retrouvé et placé dans cette église.
La tradition raconte également que Prisca aurait été baptisée par saint Pierre dans les fonds baptismaux encore utilisés aujourd'hui. Ils ont été créés à partir d'un ancien chapiteau romain réajusté et surmonté d'une statuette représentant le baptême du Christ. Au maître-autel, on peut admirer une peinture de saint Pierre baptisant Prisca réalisée par Passignano vers 1600. En 1934, des fouilles archéologiques ont permis de retrouver un Mithraeum, un lieu dédié au culte de Mithra, sous les fondations de l'église.
Seigneur mon Dieu, tu es mon espérance, mon appui dès ma jeunesse. (Ps 70)
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